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Arraystar AS-NR-004說明書

 更新時間:2018-08-07 點(diǎn)擊量:1367

 

Arraystar致力于幫助生物醫(yī)學(xué)科學(xué)研究人員了解監(jiān)管非編碼RNA(ncRNAs),這已成為21世紀(jì)生物醫(yī)學(xué)研究中吸引力和挑戰(zhàn)性的方面之一。這些非編碼RNA類包括lncRNA,環(huán)狀RNA,微小RNA,tRNA,tRF,tiRNA,snoRNA等。自2009年成立以來,我們在ncRNA研究領(lǐng)域的創(chuàng)新產(chǎn)品,深入的實(shí)驗(yàn)專業(yè)知識和強(qiáng)大的生物信息學(xué)支持了數(shù)百種高影響力的出版物。多年來,我們的客戶群已擴(kuò)展到數(shù)千個研究機(jī)構(gòu)。 

超越RNA

隨著新型非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)及其超出蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本的調(diào)控活性,RNA生物學(xué)領(lǐng)域的研究意味著超越編碼信使RNA,這是中心法則的重點(diǎn)。揭示新型ncRNA的關(guān)鍵作用的追求引起了強(qiáng)烈的科學(xué)興趣,具有發(fā)現(xiàn)新的疾病調(diào)節(jié)劑,新的生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)的誘人機(jī)會。雖然基因表達(dá)分析行業(yè)仍主要僅涵蓋mRNA,但Arraystar正在邁向新的道路并向前邁進(jìn)。 

焦點(diǎn)

除了傳統(tǒng)的mRNA表達(dá)分析之外,Arraystar的愿景還集中在長和小的非編碼RNA類的轉(zhuǎn)錄組范圍分析,每個類具有不同的RNA特性和生物活性,需要更專業(yè)的方法和生物信息學(xué)來分析:

•lncRNAs 
•環(huán)狀RNAs 
•tRNAs 
•tRFs和tiRNAs 
•snoRNAs 
•microRNAs及其靶mRNA 
•piRNAs 

 

nrStar™ Functional LncRNA PCR Array (H/M)

Product Name

Catalog No

Size

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

AS-NR-004-1

384-well/ plate

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NR-004-1-R

384-well/ plate

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

AS-NR-004M-1

384-well (2*192) / plate

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

AS-NR-004M-1-R

384-well (2*192) / plate

 

nrStar™功能性LncRNA PCR陣列概況372人/ 185小鼠金標(biāo)準(zhǔn)lncRNA具有已知的生物學(xué)功能或疾病關(guān)聯(lián)。它為研究人員提供了一種簡單,準(zhǔn)確且數(shù)據(jù)豐富的交鑰匙解決方案,可用于探索LncRNA功能及其生物標(biāo)記潛力。

全面收集以生物功能或疾病關(guān)聯(lián)為特征的*的LncRNA。

•功能和疾病LncRNA經(jīng)過仔細(xì)分類,注釋和交叉引用。

•所有引物組均在多種樣品類型中經(jīng)過*驗(yàn)證,以滿足生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的需要。

•轉(zhuǎn)錄物特異性PCR引物能夠明確,準(zhǔn)確地檢測每種單獨(dú)的LncRNA同種型。

我們建議在運(yùn)行nrStar™功能性LncRNA PCR陣列時使用我們的rtStar™First-Strand cDNA合成試劑盒  (AS-FS-001)ArraystarSYBR®GreenReal-time qPCR Master Mix,以獲得*性能。

 

•已知功能性lncRNA的*覆蓋范圍:  從的公共數(shù)據(jù)庫和具有里程碑意義的出版物中全面收集以生物功能或人類疾病關(guān)聯(lián)為特征的*的LncRNA。 

 

圖1.從Bartonicek等人收集了一些與癌癥相關(guān)的lncRNA。2016年 

 

圖2.從Devaux等人收集的一些涉及心臟通路的LncRNA。2015年

•綜合注釋:  與癌癥,心血管疾病和神經(jīng)退行性疾病等疾病相關(guān)的LncRNA經(jīng)過仔細(xì)分類,注釋和交叉引用。


表格1。注釋信息包括:
                  基于基因組位置的類:[增強(qiáng)子,反義,基因間,內(nèi)含子,雙向...] 
                  靶mRNA基因
                  機(jī)制:[信號,誘餌,支架,指導(dǎo),ceRNA,miRNA海綿,剪接...] 
                  生物功能:[細(xì)胞周期,分化,甲基化,免疫,代謝...] 
                  疾?。篬癌癥,心血管,神經(jīng)退行性疾病,腎臟,糖尿病,綜合征...] 

    注釋實(shí)施例1-癌癥相關(guān)的lncRNA NBAT-1

    
    圖3.由Arraystar注釋的NBAT-1的信息顯示在綠色矩形區(qū)域中。

    注釋實(shí)施例2 - 心血管疾病中的LncRNA Mhrt

    
    圖4.由Arraystar注釋的MHRT信息顯示在藍(lán)色矩形區(qū)域中。

    注釋實(shí)施例3-LncRNA BACE1-AS在神經(jīng)變性疾病中的應(yīng)用

    
     圖5.由Arraystar注釋的BACE1-AS的信息顯示在紅色矩形區(qū)域中。

•用于生物標(biāo)記物篩選和驗(yàn)證的強(qiáng)大工具:  所有引物組均經(jīng)過優(yōu)化,并使用多種樣品類型進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,以滿足生物標(biāo)記物發(fā)現(xiàn)的需要。

 

圖6. PCR陣列上的lncRNA片段,具有公布的生物標(biāo)記電位和效用。

•轉(zhuǎn)錄物特異性檢測:  轉(zhuǎn)錄物特異性PCR引物設(shè)計(jì)用于靶向特定外顯子或剪接點(diǎn)位點(diǎn),以明確和準(zhǔn)確地檢測每種單獨(dú)的LncRNA同種型。

•zui可靠和準(zhǔn)確的定量: 通過使用外部對照(RNA Spike-In和陽性PCR對照),基因組DNA對照和六個內(nèi)部管家基因,每個lncRNA以高準(zhǔn)確度和數(shù)據(jù)質(zhì)量進(jìn)行定量。通過經(jīng)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的算法選擇的多個參考基因的幾何平均值而不是單個參考基因進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。 

•快速簡便: 即用型PCR陣列,采用384孔板格式。整個過程可在不到4小時內(nèi)完成。

 

 

工作流程:

圖1. nrStar™功能性LncRNA PCR陣列的工作流程

 

兼容的qPCR儀器:

ABI ViiA™7 
ABI 7500和ABI 7500 FAST 
ABI 7900HT 
ABI QuantStudio™6 Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
ABI QuantStudio™7 Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
ABI QuantStudio™12K Flex實(shí)時PCR系統(tǒng)
Bio-Rad CFX384 
Bio-Rad iCycler &iQ實(shí)時PCR系統(tǒng)
Eppendorf Realplex 
QIAGEN轉(zhuǎn)子基因Q 100 
Roche LightCycler 480 
Stratagene Mx3000 
Roche LightCycler 480

 

 

Arraystar 2018年產(chǎn)品列表

 

貨號

品名

規(guī)格

品牌

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-004-1

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004-1-R

nrStar™ Human Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well/ plate

arraystar

AS-NR-004M-1

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-004M-1-R

nrStar™ Mouse Functional LncRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-001-1

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-001-1-R

NuRNA™ Human tRNA Modification Enzymes PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-002-1

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-002-1-R

NuRNA™ Human Small RNA Biogenesis Proteins PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NM-003-1

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-003-1-R

NuRNA™ Human Epitranscriptomics PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 (4x96)-well plate

arraystar

AS-NM-004-1

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array

384-well plate

arraystar

AS-NM-004-1-R

NuRNA™ Human Central Metabolism PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well plate

arraystar

AS-NR-001H-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001H-1-R

nrStar™ Human tRNA PCR Array V2.0 (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001M-1-R

nrStar™ Mouse tRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-001-1

nrStar™ Human tRNA PCR Array V1.0

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-MB-001

Seq-Star™ rRNA Removal Kit

Human/Mouse/Rat NGS RNA-Seq library preparation

arraystar

AS-MB-006-01

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-006-02

Seq-Star™ poly(A) mRNA Isolation Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-009

Seq-Star™ RNAClean and smallEnrich Beads

10mL

arraystar

AS-MB-007

Seq-Star™ DNAClean Beads

50mL

arraystar

AS-MB-008-01

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

24 reactions

arraystar

AS-MB-008-02

Seq-Star™ DNA Size Selection Kit

96 reactions

arraystar

AS-MB-010-01

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-010-02

Seq-Star™ Rapid DNA-seq Kit (Illumina, SetB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-012-01

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setA)

Adapter Barcode(1-12)

arraystar

AS-MB-012-02

Seq-Star™ Small RNA-seq Kit (Illumina, setB)

Adapter Barcode(13-24)

arraystar

AS-MB-013-01

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setA)

24 reactions

arraystar

AS-MB-013-02

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Kit (Illumina, setB)

24 reactions

arraystar

AS-PACK-001-A

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package A – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-PACK-001-B

Seq-Star™ Rapid RNA-Seq Library Prep Package B – Illumina

12 reactions

arraystar

AS-MR-005-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-005-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX-), 25mL

25mL

arraystar

AS-MR-006-5

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 5mL

5mL

arraystar

AS-MR-006-25

Arraystar SYBR® Green qPCR Master Mix(ROX+), 25mL

25mL

arraystar

AS-FS-001

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-002

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-003

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

6 reactions

arraystar

AS-FS-003-02

rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor)

12 reactions

arraystar

AS-FS-004

rtStar™ tRNA-optimized First-Strand cDNA Synthesis Kit

12 reactions

arraystar

AS-FS-005

rtStar™ tRF&tiRNA Pretreatment Kit

12 reactions

arraystar

AS-NR-002-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRF&tiRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001-1-M

rtStar™ Pre-designed Human tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-001M-1-M

rtStar™ Pre-designed Mouse tRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-004-1-M

rtStar™ Pre-designed Human Functional LncRNA Primer Sets

100 reactions

arraystar

AS-NR-002-1

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well(2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002-1-R

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (2*192) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1

nrStar™ Mouse tRF PCR Array

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-002M-1-R

nrStar™ Mouse tRF PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384-well (4*96) / plate

arraystar

AS-NR-003-1

nrStar™ Human snoRNA PCR Array

384 well / plate

arraystar

AS-NR-003-1-R

nrStar™ Human snoRNA PCR Array (Roche Light Cycler 480)

384 well / plate

arraystar

 

 

 

 

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